1946 Πρώτη Βουλευτική Εκλογή
Παρά την πολιτική παράδοση της οικογενείας του ο Μητσοτάκης δεν είχε την πρόθεση να αναμιχθεί στην πολιτική μετά την απελευθέρωση. Η ανάμιξή του όμως κατέστη αναπόφευκτη εν μέρει διότι αφενός ο πατέρας του και ο θείος του είχαν πεθάνει και δεν υπήρχε κανείς να εκπροσωπήσει πολιτικά την οικογένεια και αφετέρου λόγω του κύρους και της αναγνώρισης, που είχε κερδίσει κατά τη διάρκεια της αντίστασης. Την περίοδο εκείνη αποφάσισε να επανεκδώσει την τοπική εφημερίδα "ΚΗΡΥΞ" των Χανίων, η κυκλοφορία της οποίας είχε διακοπεί στο διάστημα της γερμανικής κατοχής. Ιδρυτής της υπήρξε ο Ελευθέριος Βενιζέλος και συνεχίζει και σήμερα να εκδίδεται.
Μετά την κατοχή εξελέγη για πρώτη φορά βουλευτής Χανίων στις εκλογές της 31 Μαρτίου 1946, με την Εθνική Πολιτική Ένωση του Σοφοκλή Βενιζέλου. Σε ηλικία 28 ετών ήταν ο νεώτερος βουλευτής της πρώτης μεταπολεμικής Βουλής, όπου με την πρώτη του κοινοβουλευτική ομιλία, πήρε θέση υπέρ της αβασίλευτης δημοκρατίας. Τη θέση αυτή υποστήριξε και στο πρώτο δημοψήφισμα και τη διατήρησε σε ολόκληρη την πολιτική του σταδιοδρομία.
